Monaca Educationではプラン毎に保有できるプロジェクトの数に上限があります。
また、不要なプロジェクトを残しておくと管理もしにくくなるため適宜削除を行いましょう。

Monaca Educationでは現在、削除の方法が2つ用意されています。

A:ダッシュボードのプロジェクト一覧からチェックボックスで選択して削除する

削除したいプロジェクトをチェックしてから削除ボタンを押します。
複数のプロジェクトに対して同時にチェックを入れることで一括削除もできます。

B :プロジェクトの設定から削除する

プロジェクトの設定の最下部に「プロジェクトの削除」ボタンがあります。